Die Kommission für experimentelle Immunologie ist zuständig für die Belange der Grundlagenforschung und für die angewandte Forschung in Immunologie und Allergologie in der SGAI und unterstützt die Lehre in Immunologie und Allergologie an Schweizerischen Universitäten. Die Kommission für experimentelle Immunologie entscheidet über Gesuche von Doktorierenden in der SGAI für Reisestipendien zum Besuch wissenschaftlicher Kongresse, nominiert die Delegierten der SGAI in internationalen Fachgesellschaften in experimenteller Immunologie und Allergologie und organisiert wissenschaftliche Meetings für Studierende in experimenteller Immunologie und Allergologie.